薬師院の入口にある仁王門は江戸時代中期の建立とされ、伽藍の西端に位置する二層門である。
　初層は門の両脇に阿形・吽形の仁王が立ち、二層には五大明王（不動・隆三世（ごうざんぜ）・軍荼利（ぐんだり）・大威徳・金剛夜叉）が、山門ならびに境内の聖域を守護している。近年部分修理を実施したところ、寛文4年（1664）刻銘の瓦が確認された。江戸時代の建築様式を良好にとどめた建築である。